Путание MySQL сообщение error/warning/info
Вам нужны права суперпользователя работать service:
$ sudo service mysql stop
или (как корень):
# service mysql stop
Используя service и chkconfig утилиты являются теперь defacto стандартом для сервиса initscript обрабатывающий на большинстве дистрибутивов Linux.
Править:
Если ни одна из вышеупомянутых работ, можно попробовать mysqladmin непосредственно:
$ sudo mysqladmin shutdown
Прочитайте то сообщение снова.
... используйте
service(8)утилита, например.service mysql stop... можно также использовать
stop(8)утилита, например.stop mysql
Вы смешиваете эти два, который заканчивает тем, что работал mysql клиент командной строки и пытающийся соединиться с stop и start базы данных по локальному серверу (который, по-видимому, не работает).
Выберите один или другой. Обратите внимание, что любому будет нужно sudo перед ним, если Вы не зарегистрированы как корень.
И, в случае, если это не было очевидно, mysql-server потребности, которые будут установлены правильно для любого из этого для работы. Это начинает казаться, что что-то - немного borked о Вашей установке.