Платформа IIS и .NET 3.5 + 4 рядом => вызывает Серверное приложение Недоступная ошибка

Вы не можете выполнить несколько версий платформы в том же пуле приложений. Решение состоит в том, чтобы поместить различные части сайта в различные пулы приложений, или обновить их всех до той же версии. Вот старый мой блог о выполнении нескольких версий платформы, но это все еще применимо.

Однако, так как Вы используете IIS7, это нечетно, что Вы столкнулись бы с ошибками как этот. Проблемой не является действительно то же. Все равно попытайтесь повредить свой сайт в несколько пулов приложений, один для каждой необходимой версии платформы. Это предотвратит столкновения.