Поместите их в поле позади некоторой области хранения. Только то, когда сервер заменяется, должно эти остатки быть избавленным. Вещи изменяются, и Вы никогда не можете быть полностью уверены в том, что Вы можете или не можете потребовать в будущем. Часть того материала, который Вы описываете, может использоваться для поддержания других машин, даже если только временно.
mod_wsgi.so был скомпилирован против более поздней версии Apache develelopment пакет, чем версия Apache, к которому Вы развертываетесь. Удостоверьтесь, что базовый пакет Apache и версия пакета разработки, против которой Вы компилируете, для той же версии Apache, и необходимо быть в порядке. Также удостоверьтесь использование новой mod_wsgi версии.