1) Да, конечно. Вот строка команд для развертывания пакета (для версии 2.0, но работал бы на 3,0): http://www.appdeploy.com/packages/detail.asp?id=1086
Короче говоря, можно сделать прямую тихую установку через классические параметры командной строки
Я не вижу ничто плохого с Вашим планом. Имейте первое резервное копирование для записи на ленту задания, перезаписывают ленту и имеют второе резервное копирование для записи на ленту задания, добавляют/завершают если не appendable. Худшее, которое произойдет, является этим, запросит другую ленту во время второй работы, если это исчерпает appendable медиа (лента).