Можно временно отключить репозиторий, содержание более старой версии несовместимого использования пакетов - disable-repo=XXX переключается, где XXX название репозитория.
Похоже, вам удалось серьезно перегрузить IIS.
Вы изменили настройки своего пула приложений с учетом такой огромной пропускной способности?
Конечно, вы не говорите, используется ли сам IIS для выполнения внешних веб-запросов - я надеюсь, вы понимаете, что это не имеет никакого отношения друг с другом в принципе.