Проверьте этот http://www.ms4u.info/2010/06/intemittent-ping-timeout-on-hyper-v.html
Это - то, как, решают проблему.
Откуда вы запускаете команду mkisofs? Вы пробовали указывать абсолютные пути? например:
mkisofs -o '/foo/test.iso' -b '/mnt/vmtest/isolinux/isolinux.bin' -c '/mnt/vmtest/isolinux/boot.cat' -no-emul-boot -boot-load-size 4 -boot-info-table /mnt/vmtest