Если все, кому нужен ssh доступ к Вашему серверу, могут использовать открытый ключ, то да, Вы можете безопасно и возможно должны отключить логины password/keyboard-interactive.
mdbtools
упакован в EPEL , поэтому вы можете добавить это репо и установить его с помощью yum, который является предпочтительным способом установки программного обеспечения на CentOS (и любой другой другое распространение).
Однако для установки из исходного кода вам, скорее всего, не хватает пакета разработки glib
, содержащего файлы заголовков C.