Создание каталога является атомарным так, чтобы не вызывал проблему. Если некоторые файлы будут тем же, то Вы будете, вероятно, видеть последний rsync, который затрагивает, файл "победит".
Кроме этого я не вижу проблем, и должно быть безопасно сделать.
попробуйте проверить файл printers.conf и закомментировать строку:
AuthInfoRequired negotiate
это настройка по умолчанию в ubuntu