Случайно перезаписал named.conf

Вы можете выполнить AXFR с помощью dig @localhost example.com axfr , чтобы получить содержимое определенной зоны (при условии, что вы разрешили передачу AXFR), но я не думаю, что существует способ перечислить настроенные зоны. Вам, вероятно, следует использовать etckeeper и делать резервные копии для подобных ситуаций; -)