У Вас могут быть открытые транзакции в журнале. Сделайте DBCC OPENTRAN на журнале и посмотрите, делаете ли Вы. Открытая транзакция собирается препятствовать тому, чтобы Вы уменьшили журнал.
Существует хорошая запись в блоге здесь, которая может предоставить Вам больше подробной информации о том, что продолжается негласно и дает Вам некоторый фон на недокументированной, но удобной команде DBCC LOGINFO.
Что вам нужно сделать, так это управлять подготовкой, исключив одну из баз данных почтовых ящиков из автоматической подготовки (с помощью командной консоли Exchange):
Set-MailboxDatabase –Identity ‘NotTheDefaultDatabase′ –IsExcludedFromProvisioning $True
Set-MailboxDatabase –Identity ‘TheCorrectDatabase′ –IsExcludedFromProvisioning $False