Другая альтернатива использует Samba, отображая его на Вашей локальной машине и просто сохранив его как нормальный файл.
SFTP также безопасен. Многие клиенты ftp поддерживают это.
Лично мне нравится опция самбы, пока Вы блокируете ее вниз, это является самым удобным и, кажется, имеет самое быстрое время отклика, по моему скромному мнению.
Это отличный вопрос. Много месяцев назад мы столкнулись с проблемой O365, когда инструмент синхронизации AD вызывал удаление всех наших почтовых ящиков. MSFT потребовалось около недели, чтобы восстановить все почтовые ящики для нас. В любом случае они рекомендуют делать резервные копии за пределами площадки, поскольку в конечном итоге они не несут ответственности за потерю данных, если это произойдет, за исключением того, что указано в SLA.
Мы работали с MessageOps, поскольку у них есть инструмент для загрузки почтовых ящиков административно, что работает довольно хорошо. Это бесплатно, если вы укажете их как своих официальных партнеров в O365.