web.config файл является единственным, который должен быть там. На вашем месте я попытался бы переустановить Пакет обновлений, который был отменен... Обычно они действительно хороши о том, чтобы быть reinstallable.
Вам нужно изменить порядок ... вы устанавливаете cookie перед движком. Переместите строку заголовка под своим правилом перезаписи, и оно должно работать.