Я разработал программное обеспечение, которое делает это. Он позволяет пользователям входить на сайт, используя свою смарт-карту, и создайте имя пользователя и пароль только для использования с Lync.
Он использует делегирование Kerberos для авторизации пользователя.
Проверьте это на http://agatdev.com/