HP MDS600 помещается в стойку HP 10636 G2?

Вы можете rsync от одного дискового местоположения до другого, но насколько я знаю, что нет никакого способа сохранить дельты rsync, использовал бы (потому что нет никакого способа гарантировать, что файлы все еще идентичны от одного поля до следующего).
Вы МОГЛИ сделать то, что Вы спрашиваете с внешним жестким диском на 1 ТБ или на 500 ГБ (rsync к этому, заберите домой его, rsync там, и т.д.) - и Вы извлекаете пользу из дополнительного устройства резервного копирования.

Кроме того, можно использовать bsdiff и bspatch для создания двоичных различных файлов, но это требует, чтобы у Вас было "исходное" наложение файлов вокруг (удваивает Ваше требование устройства хранения данных для каждого файла - хотя кратко и не нуждаясь во внешнем HD).