Должно случиться так, что у Вас есть другой сервис, который находится на автоматическом запуске и объявляет зависимость от SQL Server. То, когда Вы отключили SQL Server, этот другой зависимый сервис должен, проследило ошибку в журнал системного события, жалуясь, что сервис он зависимые на отключен. Изучите систему, даже регистрируются, кто бы ни жаловался, что SQL Server отключен, должен быть Ваш преступник, сервис, который запускает SQL Server.