У меня есть решение. Я не уверен, что это лучший способ добиться этого, но чтобы обойти это, пришлось создать уникальный каталог и отдельный сайт в IIS 8. Я настраиваю перенаправления для этого сайта, и, поскольку он указывает на уникальный каталог, настройки делают не переносится на другие сайты в IIS 8.