Nginx может помочь Вашему Apache, когда у Вас есть много медленных соединений с Вашими сайтами. Например, архитектура конечного автомата nginx не уязвима для Slowloris DDoS http://isc.sans.org/diary.html?storyid=6601.
У Вас, кажется, есть менеджер по обновлению на другой машине, чем VC, который является правильным?
Раз так действительно ли это - VM или физический?
Если бы это - VM, я испытал бы желание просто создать новый v4 ГМ VM с нуля и или изменить указатель на него в VC или использовать того же дюйм/с.
Если это является физическим (и почему был бы он?) затем я все еще испытал бы желание вытереть и восстановить - это не занимает много времени, и по крайней мере затем это 'чисто'.