Люди выполняют стопку Microsoft, потому что продукты интегрируются хорошо друг с другом. Виртуализация Microsoft еще не там, но нет сомнения, что они скоро будут. Сегодня, VMware лучше, но Microsoft все еще хороша. Если бы у Вас есть комбинированная среда, я сказал бы для движения с VMware. Если Вы - магазин Microsoft, то пойдите с Microsoft.
Это, вероятно, менее утомительно для создания нового поля Ubuntu на vSphere машине и копии по данным поврежденной Ubuntu VM к новому. Что выполняет старый сервер? Копирование данных сохранит Вас много времени, пытаясь выяснить, как восстановить цепочку снимка, когда это даже не необходимо...