вершина сообщает о подкачке в 100%, доступная свободная память

Top обычно не сообщает статистику памяти в процентах, поэтому я буду работать с предположением, что вы сами рассчитали процент освобождения памяти. Находясь в верхней части экрана, нажмите «G3», чтобы отобразить сводку памяти, используемой каждым процессом. Какой процесс занимает всю память, это ваше приложение или что-то другое, что использует ваше приложение? Если вы можете попробовать убить приложение, занимающее память, вы увидите, что через некоторое время ваша свободная память восстановится. После того, как система начала замену, может потребоваться время для восстановления. Кроме того, убедитесь, что вы действительно выделили для вашей системы достаточно физической памяти. Если выделенная память меньше 512 МБ, рассмотрите возможность использования 512 МБ в качестве базового минимума, хотя это применимо только в том случае, если ваша система является виртуализированной гостевой системой.

Также проверьте свою подкачку. Кто-то, возможно, установил высокий уровень.

cat / proc / sys / vm / swappiness

Just because you kill your largest memory-using process doesn't mean that the kernel is going to immediately start swapping pages in from disk. If those pages aren't actively being used, they're going to stay there until referenced again by the process that has those parts of memory swapped out. Swappiness will affect how aggressive the kernel is at moving things in and out of swap.

https://help.ubuntu.com/community/SwapFaq#What_is_swappiness_and_how_do_I_change_it.3F has a good discussion on what swappiness actually does and how changing it might affect your system.

Like charles said, you may have it set inappropriately high for some reason.