Пока Вы копируете DB, и у Вас есть корректный установочный носитель для существующей установки vCenter для движения с DB, необходимо всегда мочь возвратиться к рабочему vCenter.
Мы сделали то же перемещение несколько лет назад, и не имейте никаких проблем.
Не забывайте обновлять свое соединение ODBC для указания на новый сервер базы данных.
Ре: Менеджер обновлений, я думаю, что он раньше был немного облуплен, когда он прибыл в движущиеся базы данных, или переустанавливающий ГМ против существующей базы данных поэтому просто наблюдают это. Худший случай, необходимо будет получить обновления в репозиторий снова так больше времени, чем что-нибудь.