Я знаю не попытка ответить на Вашу проблему, но у меня есть несколько изображений VMware, которые уплотняются обоснованно регулярно, и у меня никогда не было проблемы, которую Вы описываете.
Я попробовал бы еще раз и видел бы, получаете ли Вы те же ошибки, возможно, что это был 'незначительный сбой' (но я предполагаю, что все еще не помогает, если Вы не можете больше доверять операции),
Поскольку Вы уже обнаружили, это не безопасная работа. Любой вид оптового управления файлом VHD прямо попадает в категорию "вещей, которые должны сделать любую паузу администратора и думать о резервных копиях".
Очевидно, Вы были достаточно прилежны для сохранения резервной копии, и она служила Вам хорошо.
Безопасно, если Вы полностью проверили файловую систему на наличие ошибок сначала. Уплотнение просто создает новый файл VHD и копирует все файлы в него. Старый файл не изменяется вообще, пока операция не завершается (в котором времени старый файл удален). Старая пословица применяется хотя, мусор в мусоре средств.